圍繞著「聖杯」而展開的戰爭即將揭幕！少年衛宮士郎一直期望有朝一日，能成為像救了自己的養父切嗣那樣的正義英雄。某一天士郎目睹了一場怪異的戰鬥，生命卻因此遭到威脅。但就在他陷入絕境之際，出現了一名救他脫險，名喚「劍兵」的少女，而且她還自稱是受到士郎的召喚而前來，並與他訂下主從契約…